SILAC质谱分析即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记质谱分析技术，广泛应用于探究细胞内蛋白质动态变化及其功能。SILAC（Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell Culture）即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记技术。SILAC质谱分析通过在细胞培养中引入轻重氨基酸的稳定同位素标记，实现对蛋白质的定量分析。此技术的核心在于利用轻重标记的氨基酸取代天然氨基酸，从而在蛋白质合成过程中引入质量差异。这一差异在质谱分析中能够显著地表现出来，使得我们可以通过比较不同样本中蛋白质的丰度变化，来揭示生物学过程的动态变化。通过SILAC质谱技术，研究人员可以更为精准地定量比较不同状态（如疾病与健康、药物处理前后）下的蛋白质组变化，进而揭示潜在的生物学机制。例如，在癌症研究中，SILAC质谱可用于识别癌细胞与正常细胞之间的蛋白质表达差异，从而帮助发现新的治疗靶点。此外，SILAC质谱还可用于研究药物的作用机制，通过分析药物处理前后蛋白质表达水平的变化，帮助理解药物作用的生物学基础。

一、SILAC质谱分析技术流程与注意事项

1、细胞培养

将细胞分为两组或多组，一组在正常培养基中培养（含有天然氨基酸），另外的组在添加了稳定同位素标记氨基酸的培养基中培养。一般需要经过 5 - 6 个细胞倍增周期，以确保细胞内大部分蛋白质都被标记上相应的氨基酸。

2、样品处理

培养结束后，将不同标记的细胞混合，然后进行裂解、蛋白质提取、酶解等处理步骤，将蛋白质分解为肽段，以便进行质谱分析。

3、质谱分析

肽段进入质谱仪后，根据其质荷比进行分离和检测。由于标记和未标记肽段的质量差异，在质谱图中可以清楚地分辨出来。通过比较不同标记肽段的信号强度，可以实现对蛋白质的相对定量。例如，如果重型标记肽段的信号强度是轻型标记肽段信号强度的两倍，那么可以推断该蛋白质在重型标记细胞中的表达量是轻型标记细胞中的两倍。

4、数据分析与定量比较

使用专门的软件对质谱数据进行分析，识别和定量不同实验条件下的蛋白质。数据分析过程中，需注意对定量数据的标准化和误差分析，以确保结果的可靠性。

二、SILAC质谱分析优势与常见问题

1、技术优势

（1）高灵敏度和准确性：通过同位素标记，SILAC质谱能够实现高灵敏度的蛋白质定量。

（2）适用性广：可用于各种类型的细胞系，尤其适合于复杂的生物样本。

（3）动态监测：能够实时监测蛋白质在细胞内的动态变化。

2、常见问题

（1）标记效率：不同细胞系的标记效率可能不同，需要通过实验验证标记的完全性。

（2）复杂性：数据分析相对复杂，需要使用专门的软件和方法进行处理。

（3）成本因素：标记氨基酸和高分辨质谱仪的使用可能增加实验成本。

凭借先进的技术和丰富的经验，百泰派克生物科技为客户提供高质量的SILAC质谱分析（稳定同位素标记细胞培养质谱）服务。我们致力于帮助客户实现最优的蛋白质组学分析，通过专业的团队和完善的技术平台，确保实验的高效性和数据的准确性。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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